यदि पृथ्वी पर सूक्ष्मजीव न होते, तो हमारे पर्यावरण में अपशिष्ट पदार्थों का जमाव हो जाता। सूक्ष्मजीव गिरी हुई पत्तियों, मृत पौधों और जंतुओं के शरीर को विघटित करके जटिल पदार्थों को सरल और पोषकों से समृद्ध पदार्थों में परिवर्तित कर देते हैं।

इस विघटन प्रक्रिया के बिना, महत्वपूर्ण पोषक तत्व मिट्टी में वापस नहीं लौट पाते, जिससे पौधों का उत्तम विकास रुक जाता।

अतः, सूक्ष्मजीवों के न होने पर अपशिष्ट का पुनर्चक्रण नहीं हो पाता और प्रकृति में पोषक तत्वों का संतुलन बिगड़ जाता, जिससे पर्यावरण अस्वच्छ हो जाता।