सूक्ष्मजीवों की सहायता से प्रदूषण और तेल रिसाव जैसी पर्यावरणीय समस्याओं का समाधान किया जा सकता है। वैज्ञानिक आनंद मोहन चक्रवर्ती ने एक ऐसा जीवाणु विकसित किया था जो तेल रिसाव को विघटित करके पर्यावरण को स्वच्छ बना सकता है।

इसके अतिरिक्त, सूक्ष्मजीव अपशिष्ट को विघटित करके हमारे पर्यावरण को स्वच्छ करने में सहायता करते हैं। वे पौधों की वृद्धि में भी सहायता करते हैं और दलहनी (फलीदार) फसलों की जड़ों में रहकर उन्हें पोषक तत्व प्रदान करते हैं, जिससे कृषि संबंधी समस्याओं का समाधान होता है।

हमारी आँत में पाए जाने वाले कुछ जीवाणु पाचन में सहायता करते हैं, जिससे पाचन संबंधी समस्याओं का भी समाधान किया जा सकता है। इस प्रकार, सूक्ष्मजीवों का उपयोग पर्यावरण की रक्षा और जीवन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाने वाली समस्याओं के समाधान में किया जा सकता है।