बिस्मिल्ला खाँ का मुहर्रम से गहरा जुड़ाव रहा है, जो काशी की गंगा-जमुनी संस्कृति का जीता-जागता प्रमाण है। उनके लिए मुहर्रम केवल एक त्योहार नहीं, बल्कि सांस्कृतिक एकता का प्रतीक था।

काशी में बाबा विश्वनाथ और बिस्मिल्ला खाँ जिस प्रकार एक-दूसरे के पूरक रहे हैं, ठीक उसी तरह मुहर्रम-ताजिया और होली-अबीर, गुलाल की संस्कृति भी एक-दूसरे की पूरक रही है। यह उनकी मिली-जुली संस्कृति को दर्शाता है।

बिस्मिल्ला खाँ हमेशा से दो कौमों को एक होने और आपस में भाईचारे के साथ रहने की प्रेरणा देते रहे। वे एक सच्चे सुर साधक थे, जिनकी फूंक में अजान की तासीर उतरती थी और जो खुदा से एक ऐसे सुर की याचना करते थे जिससे आँखों से सच्चे मोती की तरह अनगढ़ आँसू निकल आएँ।

इस प्रकार, मुहर्रम से उनका यह जुड़ाव उनकी धर्मनिरपेक्ष सोच का परिचायक है। उनकी शहनाई की मंगलध्वनि और संगीत किसी एक समुदाय तक सीमित नहीं थे, बल्कि पूरी मानवता को एक सूत्र में बाँधते थे।