आंतरिक निषेचन में युग्मकों का संलयन मादा के शरीर के अंदर होता है, जिससे वे बाहरी पर्यावरण के प्रतिकूल प्रभावों से सुरक्षित रहते हैं। इसके विपरीत, बाह्य निषेचन में युग्मक शरीर के बाहर जल में संलयित होते हैं, जहाँ उन्हें अधिक जोखिम रहता है।